贷款申请记录在两年以后会自动消除。贷款申请记录是指贷款审批查询记录，征信只会显示近两年内的贷款审批查询记录，当查询记录保留时间超过2年，那么征信会隐藏该记录，因此也就可以视为两年以前的查询记录被征信系统自动消除了。
征信查询记录过多会将个人征信弄花，征信被弄花以后，会导致后续申请信贷业务审核更加严格。用户可以通过控制贷款申请频率与申请次数来减少征信查询记录的产生，通常来说一个月之内征信查询次数不宜超过5次，超过5次就会被金融机构判断为用户的征信花了。
另外，贷款申请记录较多还有可能直接影响贷款审核结果，毕竟经常办理信贷业务会让金融机构认为用户经济状况不佳，这样金融机构就更加不愿意借钱给用户了。